More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0418 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  100 
 
 
333 aa  671    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  71.39 
 
 
333 aa  474  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  73.19 
 
 
332 aa  468  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  64.46 
 
 
394 aa  413  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  64.56 
 
 
337 aa  411  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.35 
 
 
334 aa  399  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.25 
 
 
359 aa  398  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  65.57 
 
 
335 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  64.78 
 
 
337 aa  375  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  53.35 
 
 
337 aa  326  3e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.05 
 
 
340 aa  323  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  54.95 
 
 
334 aa  320  3e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  54.74 
 
 
338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  53.35 
 
 
337 aa  317  2e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  52.6 
 
 
327 aa  311  6.999999999999999e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  52.31 
 
 
326 aa  309  5e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  51.83 
 
 
343 aa  306  3e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2285  GTPase ObgE  53.54 
 
 
338 aa  298  1e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.397881  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  49.1 
 
 
408 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  48.49 
 
 
408 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  48.8 
 
 
408 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  48.49 
 
 
408 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  48.77 
 
 
343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  46.99 
 
 
407 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  47.29 
 
 
407 aa  281  9e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  48.37 
 
 
338 aa  280  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  46.69 
 
 
407 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  48.48 
 
 
329 aa  278  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  48.48 
 
 
329 aa  278  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  49.85 
 
 
354 aa  279  6e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  49.55 
 
 
354 aa  278  8e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  49.55 
 
 
354 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  48.78 
 
 
370 aa  277  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  48.05 
 
 
405 aa  276  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  47.75 
 
 
406 aa  275  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  47.73 
 
 
353 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  49.85 
 
 
338 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  48.05 
 
 
427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  47.75 
 
 
406 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  49.25 
 
 
338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  47.6 
 
 
341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  47.31 
 
 
341 aa  272  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  46.65 
 
 
338 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.56 
 
 
369 aa  270  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  49.55 
 
 
370 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  47.48 
 
 
406 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0504  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.92 
 
 
368 aa  268  1e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  48.79 
 
 
352 aa  268  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  48.46 
 
 
387 aa  267  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  48.63 
 
 
355 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  48.2 
 
 
353 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  47.75 
 
 
364 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  47.45 
 
 
361 aa  266  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  47.72 
 
 
343 aa  265  5.999999999999999e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  48.65 
 
 
370 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  46.32 
 
 
402 aa  265  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.05 
 
 
371 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  47.2 
 
 
338 aa  263  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.25 
 
 
396 aa  263  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  51.36 
 
 
397 aa  263  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.73 
 
 
458 aa  262  6e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  48.65 
 
 
338 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  49.54 
 
 
373 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  48.05 
 
 
364 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  45.75 
 
 
439 aa  261  1e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  48.74 
 
 
354 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  46.27 
 
 
346 aa  260  2e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  49.23 
 
 
366 aa  260  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  46.69 
 
 
362 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  49.54 
 
 
372 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  47.4 
 
 
341 aa  260  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.08 
 
 
350 aa  260  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  47.4 
 
 
371 aa  260  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  47.75 
 
 
364 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  49.54 
 
 
373 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  48.35 
 
 
372 aa  259  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  49.54 
 
 
372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  49.54 
 
 
372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  49.54 
 
 
372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  49.54 
 
 
372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  49.54 
 
 
372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  49.54 
 
 
372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  48.04 
 
 
419 aa  259  5.0000000000000005e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.45 
 
 
356 aa  258  7e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  48.3 
 
 
365 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.11 
 
 
336 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.37 
 
 
429 aa  258  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  47.99 
 
 
362 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1054  GTPase ObgE  46.95 
 
 
341 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87865  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  47.42 
 
 
357 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  46.01 
 
 
351 aa  257  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  47.68 
 
 
365 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  46.99 
 
 
357 aa  256  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  45.95 
 
 
357 aa  256  3e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.56 
 
 
348 aa  256  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  48.57 
 
 
348 aa  256  4e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.97 
 
 
426 aa  256  5e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  47.29 
 
 
370 aa  255  7e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  45.65 
 
 
439 aa  255  7e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.99 
 
 
425 aa  255  8e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>