More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3380 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  100 
 
 		 337 aa  688    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  68.18 
 
 		 334 aa  438  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  67.58 
 
 		 337 aa  435  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  64.56 
 
 		 394 aa  414  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  67.27 
 
 		 335 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.42 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  64.78 
 
 		 333 aa  371  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  64.18 
 
 		 332 aa  374  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  58.93 
 
 		 333 aa  363  2e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  58.84 
 
 		 334 aa  360  1e-98  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.73 
 
 		 340 aa  315  9e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  53.21 
 
 		 337 aa  309  4e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  52 
 
 		 327 aa  306  3e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  51.67 
 
 		 337 aa  301  8.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  50.91 
 
 		 326 aa  294  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  52.57 
 
 		 338 aa  293  4e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  50.46 
 
 		 343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2285  GTPase ObgE  50.76 
 
 		 338 aa  272  5.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.397881  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  50.51 
 
 		 427 aa  270  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  44.65 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.76 
 
 		 425 aa  259  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0504  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.59 
 
 		 368 aa  259  7e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.52 
 
 		 415 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  45.95 
 
 		 338 aa  256  6e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  46.27 
 
 		 338 aa  256  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  46.29 
 
 		 338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.74 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  44.68 
 
 		 329 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  46.67 
 
 		 423 aa  253  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  44.68 
 
 		 329 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4144  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.73 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.28 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  47.15 
 
 		 387 aa  252  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  46.71 
 
 		 428 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1414  GTPase ObgE  47.26 
 
 		 369 aa  251  2e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  44.51 
 
 		 338 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.44 
 
 		 429 aa  249  6e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  44.48 
 
 		 354 aa  248  8e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  44.48 
 
 		 354 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  43.47 
 
 		 338 aa  248  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  44.48 
 
 		 354 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  44.48 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.14 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.02 
 
 		 417 aa  246  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  45.62 
 
 		 424 aa  247  3e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  47.67 
 
 		 434 aa  246  6e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  45.36 
 
 		 435 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  45.45 
 
 		 343 aa  245  9e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  45.36 
 
 		 435 aa  245  9e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  44.51 
 
 		 428 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.94 
 
 		 426 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  44.55 
 
 		 439 aa  244  9.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.45 
 
 		 350 aa  243  3.9999999999999997e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  45.22 
 
 		 347 aa  242  5e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.41 
 
 		 438 aa  242  7.999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.03 
 
 		 482 aa  241  2e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1536  GTPase ObgE  44.44 
 
 		 344 aa  241  2e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  46.25 
 
 		 428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  46.08 
 
 		 419 aa  239  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.44 
 
 		 369 aa  239  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  45.77 
 
 		 432 aa  239  5e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  45.43 
 
 		 343 aa  239  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  45.6 
 
 		 354 aa  238  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0185  GTPase ObgE  45.7 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  45.23 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.8 
 
 		 348 aa  237  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  44.21 
 
 		 428 aa  238  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.95 
 
 		 458 aa  237  2e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  45.23 
 
 		 338 aa  237  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  47.9 
 
 		 338 aa  236  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0469  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.86 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  45.4 
 
 		 349 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  44.38 
 
 		 407 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  44.21 
 
 		 428 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0131  GTPase ObgE  46.02 
 
 		 356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  44.51 
 
 		 407 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  43.21 
 
 		 329 aa  236  6e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.72 
 
 		 426 aa  235  7e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  43.9 
 
 		 428 aa  235  8e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  43.9 
 
 		 428 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  43.9 
 
 		 428 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  43.9 
 
 		 428 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  47.42 
 
 		 349 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  43.6 
 
 		 428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.98 
 
 		 437 aa  233  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02391  GTPase ObgE  43.12 
 
 		 329 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  43.6 
 
 		 428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  44.75 
 
 		 433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  47.18 
 
 		 428 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  47.18 
 
 		 428 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  44.21 
 
 		 428 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3419  GTPase ObgE  44.34 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  43.69 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  44.38 
 
 		 437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  44.51 
 
 		 427 aa  233  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  46.55 
 
 		 359 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1846  GTP1/OBG domain-containing protein  45.23 
 
 		 346 aa  232  6e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.44 
 
 		 680 aa  232  6e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  46.18 
 
 		 342 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  46.18 
 
 		 342 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>