More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0185 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0185  GTPase ObgE  100 
 
 		 347 aa  698    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0100  GTPase ObgE  78.72 
 
 		 345 aa  510  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0091  GTPase ObgE  77.81 
 
 		 350 aa  508  1e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0131  GTPase ObgE  78.72 
 
 		 356 aa  508  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1536  GTPase ObgE  62.61 
 
 		 344 aa  387  1e-106  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0504  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.77 
 
 		 368 aa  384  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1726  GTPase ObgE  60.66 
 
 		 376 aa  363  2e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1414  GTPase ObgE  63.86 
 
 		 369 aa  347  2e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  56.77 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  46.82 
 
 		 346 aa  271  1e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.61 
 
 		 426 aa  269  5.9999999999999995e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.95 
 
 		 340 aa  268  7e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.46 
 
 		 334 aa  268  8e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  48.21 
 
 		 333 aa  268  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  47.2 
 
 		 394 aa  265  8.999999999999999e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  53.19 
 
 		 326 aa  264  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.29 
 
 		 333 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  51.76 
 
 		 338 aa  260  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  46.94 
 
 		 327 aa  260  3e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  49.65 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  47.08 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  49.35 
 
 		 395 aa  257  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1683  GTPase ObgE  45.83 
 
 		 405 aa  256  4e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0638359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  50.35 
 
 		 397 aa  255  7e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1601  GTPase ObgE  45.24 
 
 		 402 aa  255  8e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000135042  hitchhiker  0.000110073 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  47.52 
 
 		 387 aa  255  8e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1504  GTPase ObgE  45.54 
 
 		 405 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  46.37 
 
 		 336 aa  255  1.0000000000000001e-66  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  51.24 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  49.51 
 
 		 422 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  47.48 
 
 		 343 aa  253  3e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1681  GTPase ObgE  46.59 
 
 		 339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00207916  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  44.7 
 
 		 439 aa  252  6e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  52.86 
 
 		 423 aa  252  6e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  51.8 
 
 		 427 aa  252  8.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0498  GTPase ObgE  46.59 
 
 		 339 aa  252  8.000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072734  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.77 
 
 		 425 aa  251  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  51.41 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  47.81 
 
 		 407 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  45.7 
 
 		 337 aa  249  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  47.14 
 
 		 407 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  48.18 
 
 		 338 aa  249  6e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  42.86 
 
 		 353 aa  249  6e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  46.11 
 
 		 337 aa  248  8e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  47.96 
 
 		 357 aa  248  9e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  43.45 
 
 		 408 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.49 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  43.45 
 
 		 408 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  43.62 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  43.24 
 
 		 408 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  43.45 
 
 		 408 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.97 
 
 		 680 aa  247  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.11 
 
 		 434 aa  247  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  46.78 
 
 		 428 aa  247  2e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  45.02 
 
 		 338 aa  246  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  44.38 
 
 		 332 aa  246  6e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  46.38 
 
 		 407 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.03 
 
 		 429 aa  245  6.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  49.48 
 
 		 347 aa  245  8e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.32 
 
 		 359 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  48.33 
 
 		 419 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  46.31 
 
 		 428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  42.86 
 
 		 402 aa  243  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  47.14 
 
 		 406 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00015  GTPase ObgE  49.31 
 
 		 350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178881  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.29 
 
 		 396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  48.94 
 
 		 338 aa  242  6e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  41.45 
 
 		 370 aa  242  7e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  47.72 
 
 		 358 aa  242  7e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  48.34 
 
 		 435 aa  242  9e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  48.34 
 
 		 435 aa  241  9e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  49.3 
 
 		 338 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  44.21 
 
 		 365 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  47.6 
 
 		 333 aa  241  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  42.27 
 
 		 341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  41.98 
 
 		 341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  48.51 
 
 		 335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  46.98 
 
 		 345 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  47.3 
 
 		 364 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.73 
 
 		 356 aa  239  4e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  47.97 
 
 		 338 aa  239  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  44.11 
 
 		 405 aa  239  5e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1748  GTPase ObgE  43.23 
 
 		 382 aa  239  6.999999999999999e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0657373  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  49.49 
 
 		 338 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  45.29 
 
 		 432 aa  238  8e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  47.74 
 
 		 392 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  42.82 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  44.61 
 
 		 428 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  46.62 
 
 		 364 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  44.61 
 
 		 428 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  41.62 
 
 		 500 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  42.44 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  46.96 
 
 		 366 aa  236  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  44.31 
 
 		 428 aa  237  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  44.81 
 
 		 365 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  44.29 
 
 		 424 aa  237  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1121  GTPase ObgE  50 
 
 		 350 aa  237  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.261529  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  44.31 
 
 		 428 aa  236  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  44.31 
 
 		 428 aa  236  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  48.12 
 
 		 334 aa  236  4e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>