More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0100 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0100  GTPase ObgE  100 
 
 
345 aa  685    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0091  GTPase ObgE  96.81 
 
 
350 aa  616  1e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0131  GTPase ObgE  96.52 
 
 
356 aa  613  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0185  GTPase ObgE  78.72 
 
 
347 aa  511  1e-144  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1536  GTPase ObgE  61 
 
 
344 aa  379  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1726  GTPase ObgE  61.94 
 
 
376 aa  367  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0504  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.04 
 
 
368 aa  364  1e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  57.1 
 
 
347 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1414  GTPase ObgE  58.9 
 
 
369 aa  333  3e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  51.08 
 
 
346 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.14 
 
 
426 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  48.41 
 
 
337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  47.18 
 
 
394 aa  269  7e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  53.15 
 
 
338 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.18 
 
 
334 aa  266  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  53.85 
 
 
338 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  49.55 
 
 
337 aa  265  5.999999999999999e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  51.06 
 
 
346 aa  265  1e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  48.96 
 
 
333 aa  261  1e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  51.05 
 
 
407 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.92 
 
 
340 aa  261  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  46.96 
 
 
439 aa  260  3e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  50.7 
 
 
407 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  46.57 
 
 
427 aa  259  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  48.68 
 
 
407 aa  258  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1601  GTPase ObgE  47.02 
 
 
402 aa  259  7e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000135042  hitchhiker  0.000110073 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  44.44 
 
 
402 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  46.49 
 
 
338 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  46.78 
 
 
327 aa  257  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  50.68 
 
 
338 aa  256  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  48.55 
 
 
338 aa  256  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  48.36 
 
 
408 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  48.36 
 
 
408 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  52.13 
 
 
326 aa  256  5e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  50.51 
 
 
338 aa  256  5e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  47.94 
 
 
332 aa  255  6e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  48.03 
 
 
408 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  47.28 
 
 
357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.28 
 
 
356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  47.52 
 
 
387 aa  254  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1683  GTPase ObgE  46.13 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0638359  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  45.05 
 
 
336 aa  253  3e-66  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  45.7 
 
 
343 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  50.35 
 
 
397 aa  253  5.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1504  GTPase ObgE  45.24 
 
 
405 aa  252  7e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.37 
 
 
434 aa  252  9.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  43.82 
 
 
408 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  43.62 
 
 
357 aa  251  1e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  49.83 
 
 
347 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  47.52 
 
 
428 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  50 
 
 
395 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  49.49 
 
 
406 aa  250  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  47.8 
 
 
338 aa  249  3e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  47.31 
 
 
423 aa  250  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  48.81 
 
 
428 aa  250  3e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  43.64 
 
 
341 aa  249  4e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  49.11 
 
 
428 aa  249  5e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  49.11 
 
 
428 aa  249  5e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1748  GTPase ObgE  45.62 
 
 
382 aa  248  1e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0657373  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.71 
 
 
333 aa  248  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  50 
 
 
406 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  50.18 
 
 
337 aa  248  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  45.11 
 
 
356 aa  247  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  44.21 
 
 
349 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  42.9 
 
 
358 aa  247  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  50 
 
 
406 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.53 
 
 
429 aa  246  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  46.26 
 
 
435 aa  246  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1681  GTPase ObgE  45.86 
 
 
339 aa  247  3e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00207916  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  43.35 
 
 
341 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  43.7 
 
 
345 aa  246  4e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0498  GTPase ObgE  45.86 
 
 
339 aa  246  4.9999999999999997e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072734  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1006  GTPase ObgE  46.49 
 
 
389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134861  decreased coverage  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  50.51 
 
 
435 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  51.54 
 
 
440 aa  245  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  45.92 
 
 
405 aa  245  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  45.8 
 
 
432 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.6 
 
 
396 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1121  GTPase ObgE  48.24 
 
 
350 aa  244  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.261529  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.36 
 
 
359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  42.07 
 
 
353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  46.99 
 
 
424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  43.95 
 
 
370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  50.18 
 
 
354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  50.18 
 
 
354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.35 
 
 
425 aa  242  6e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  49.82 
 
 
354 aa  242  7e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  49.13 
 
 
419 aa  241  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.79 
 
 
680 aa  241  1e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  43.06 
 
 
364 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.96 
 
 
438 aa  240  2e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  42.77 
 
 
338 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  44.87 
 
 
352 aa  241  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  46.62 
 
 
338 aa  240  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  51.88 
 
 
335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  43.95 
 
 
337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  46.88 
 
 
353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  48.98 
 
 
422 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  43.6 
 
 
397 aa  239  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.99 
 
 
348 aa  239  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>