More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3727 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3727  ribosome-associated GTPase EngA  100 
 
 		 518 aa  1026    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  38.05 
 
 		 441 aa  347  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.48 
 
 		 438 aa  345  8e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  36.33 
 
 		 440 aa  344  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  39.17 
 
 		 460 aa  342  9e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  38.34 
 
 		 490 aa  335  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  37.2 
 
 		 441 aa  335  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3010  GTP-binding protein EngA  40.04 
 
 		 495 aa  334  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  34.78 
 
 		 441 aa  332  9e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  39.13 
 
 		 456 aa  331  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  37.99 
 
 		 460 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3308  GTP-binding protein EngA  38.41 
 
 		 487 aa  330  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  39.92 
 
 		 447 aa  330  3e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1232  GTP-binding protein EngA  38.41 
 
 		 488 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1303  GTP-binding protein EngA  38.41 
 
 		 488 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1233  GTP-binding protein EngA  38.41 
 
 		 488 aa  330  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2648  GTP-binding protein EngA  38.62 
 
 		 488 aa  330  4e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  40.54 
 
 		 467 aa  330  4e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3005  GTP-binding protein EngA  37.55 
 
 		 490 aa  330  5.0000000000000004e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4247  GTP-binding protein EngA  38.23 
 
 		 498 aa  328  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1262  GTP-binding protein EngA  39.64 
 
 		 495 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2886  GTP-binding protein EngA  37.94 
 
 		 490 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684219  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2733  GTP-binding protein EngA  38.14 
 
 		 494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0625  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.55 
 
 		 480 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1122  GTP-binding protein EngA  37.94 
 
 		 497 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.827994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  35.71 
 
 		 436 aa  327  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  35.71 
 
 		 436 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  35.71 
 
 		 436 aa  327  3e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  35.71 
 
 		 436 aa  327  3e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  35.71 
 
 		 436 aa  327  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  35.71 
 
 		 436 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  35.71 
 
 		 436 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  35.71 
 
 		 436 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2663  GTP-binding protein EngA  37.94 
 
 		 490 aa  327  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.194974 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02403  GTP-binding protein EngA  37.94 
 
 		 490 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000560332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1157  small GTP-binding protein  37.94 
 
 		 490 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2662  GTP-binding protein EngA  37.94 
 
 		 490 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000307508  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02365  hypothetical protein  37.94 
 
 		 490 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00134909  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2795  GTP-binding protein EngA  37.94 
 
 		 490 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000215643  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1166  GTP-binding protein EngA  37.94 
 
 		 490 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000585661  normal  0.0127623 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3735  GTP-binding protein EngA  37.94 
 
 		 490 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0134821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0733  GTP-binding protein EngA  38.46 
 
 		 500 aa  325  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2292  GTP-binding protein EngA  38.65 
 
 		 465 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0406895  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1172  GTP-binding protein EngA  37.48 
 
 		 489 aa  324  2e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.120565  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2361  GTP-binding protein EngA  39.23 
 
 		 488 aa  323  5e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.596104  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01071  GTP-binding protein EngA  37.33 
 
 		 498 aa  323  6e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0414  GTP-binding protein EngA  38.07 
 
 		 495 aa  322  8e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0317617  hitchhiker  0.000999032 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1297  GTP-binding protein EngA  38.07 
 
 		 495 aa  322  8e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1190  GTP-binding protein EngA  38.07 
 
 		 495 aa  322  8e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000499446  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2204  GTP-binding protein EngA  38.46 
 
 		 465 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1260  GTP-binding protein EngA  38.41 
 
 		 491 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00475437  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1325  GTP-binding protein EngA  35.91 
 
 		 511 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.359502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1309  GTP-binding protein EngA  38.41 
 
 		 490 aa  318  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00502538  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3106  GTP-binding protein EngA  39.68 
 
 		 479 aa  318  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.564911 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1654  GTP-binding protein EngA  37.88 
 
 		 465 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004345  GTP-binding protein EngA  36.84 
 
 		 498 aa  317  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  37.88 
 
 		 495 aa  317  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  37.57 
 
 		 446 aa  317  4e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2545  GTP-binding protein EngA  38.38 
 
 		 458 aa  316  7e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2986  GTP-binding protein EngA  38.66 
 
 		 488 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.306969  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3144  GTP-binding protein EngA  38.41 
 
 		 488 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0749903 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1377  GTP-binding protein EngA  38.41 
 
 		 488 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.694687  normal  0.70956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3001  GTP-binding protein EngA  38.41 
 
 		 488 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2448  GTP-binding protein EngA  36.81 
 
 		 459 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14966  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3605  GTP-binding protein EngA  37.8 
 
 		 494 aa  313  6.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1120  GTP-binding protein EngA  37.04 
 
 		 488 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06890  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  35.13 
 
 		 444 aa  311  2e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.632761 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  38.39 
 
 		 464 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4633  GTP-binding protein EngA  38.42 
 
 		 511 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0762  GTP-binding protein EngA  39.17 
 
 		 467 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0334743 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2203  GTP-binding protein EngA  38.08 
 
 		 456 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0857  GTP-binding protein EngA  34.75 
 
 		 487 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0292  GTP-binding protein EngA  36.18 
 
 		 494 aa  309  8e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  37.85 
 
 		 449 aa  309  9e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  37.85 
 
 		 449 aa  309  9e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0887  GTP-binding protein EngA  34.75 
 
 		 487 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0900  GTP-binding protein EngA  35.33 
 
 		 487 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256408 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2317  GTP-binding protein EngA  37.65 
 
 		 470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318648  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3126  GTP-binding protein EngA  37.25 
 
 		 454 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4321  GTP-binding protein EngA  34.75 
 
 		 487 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000597657 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0598  GTP-binding protein EngA  37.58 
 
 		 469 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3084  GTP-binding protein EngA  36.93 
 
 		 500 aa  306  6e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4625  GTP-binding protein EngA  38.57 
 
 		 447 aa  306  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137577  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  35.59 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  37.75 
 
 		 473 aa  305  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1438  GTP-binding protein EngA  35.18 
 
 		 471 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0591  GTP-binding protein EngA  39.13 
 
 		 472 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3073  GTP-binding protein EngA  31.99 
 
 		 435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.348074  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0375  GTP-binding protein EngA  38.23 
 
 		 483 aa  303  5.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09700  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  33.94 
 
 		 438 aa  303  5.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.253075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  36.44 
 
 		 438 aa  303  6.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1315  GTP-binding protein EngA  35.84 
 
 		 493 aa  302  9e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14930  GTP-binding protein EngA  35.84 
 
 		 493 aa  302  9e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  34.06 
 
 		 436 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0390  GTP-binding protein EngA  37.83 
 
 		 483 aa  301  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.270758  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1879  GTP-binding protein EngA  34.73 
 
 		 437 aa  300  4e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.44 
 
 		 464 aa  300  4e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1131  GTP-binding protein EngA  35.8 
 
 		 473 aa  298  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2028  GTP-binding protein EngA  36.04 
 
 		 455 aa  297  2e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.89204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1009  GTPase  34.92 
 
 		 442 aa  296  5e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>