13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4855 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0348  hypothetical protein  54.28 
 
 		 928 aa  971    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.451074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0373  hypothetical protein  54.29 
 
 		 928 aa  948    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.223606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4855  hypothetical protein  100 
 
 		 934 aa  1883    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0413  hypothetical protein  28.86 
 
 		 1074 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754384  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5119  hypothetical protein  26.58 
 
 		 1076 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  22.45 
 
 		 1495 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4884  hypothetical protein  22.88 
 
 		 768 aa  52  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4425  hypothetical protein  20.85 
 
 		 1148 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.669526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4993  hypothetical protein  29.7 
 
 		 1104 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  25 
 
 		 1459 aa  49.3  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0527  type III effector HopAC1  30.12 
 
 		 2042 aa  48.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  23.65 
 
 		 1395 aa  47  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  24.08 
 
 		 1498 aa  46.2  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>