12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0527 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4993  hypothetical protein  77.26 
 
 		 1104 aa  1688    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4996  hypothetical protein  70.23 
 
 		 973 aa  1348    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0527  type III effector HopAC1  100 
 
 		 2042 aa  4177    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4586  hypothetical protein  34.83 
 
 		 1047 aa  184  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4623  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1100 aa  140  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4483  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1074 aa  138  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1406  type III effector HopB1  32.4 
 
 		 466 aa  107  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.768056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0908  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1143 aa  78.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5021  hypothetical protein  39.51 
 
 		 873 aa  69.7  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0504  hypothetical protein  39.47 
 
 		 882 aa  70.1  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1269  hypothetical protein  37.5 
 
 		 848 aa  50.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  0.53665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4855  hypothetical protein  30.12 
 
 		 934 aa  48.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>