14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1269 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1269  hypothetical protein  100 
 
 		 848 aa  1740    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  0.53665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5021  hypothetical protein  37.03 
 
 		 873 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0504  hypothetical protein  36.65 
 
 		 882 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4586  hypothetical protein  28.06 
 
 		 1047 aa  206  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5065  hypothetical protein  31.21 
 
 		 716 aa  172  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4938  hypothetical protein  30.26 
 
 		 716 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3656  hypothetical protein  20.77 
 
 		 936 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2615  cytotoxic necrotizing factor  27.34 
 
 		 1014 aa  59.7  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5022  hypothetical protein  22.13 
 
 		 1042 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4330  hypothetical protein  19.31 
 
 		 893 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557675 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0527  type III effector HopAC1  37.5 
 
 		 2042 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1537  hypothetical protein  19.31 
 
 		 903 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0668197  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4996  hypothetical protein  35.94 
 
 		 973 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3899  hypothetical protein  20.73 
 
 		 917 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.749066  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>