15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3656 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4330  hypothetical protein  53.15 
 
 		 893 aa  934    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557675 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1537  hypothetical protein  53.33 
 
 		 903 aa  948    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0668197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3899  hypothetical protein  49.79 
 
 		 917 aa  901    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.749066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3656  hypothetical protein  100 
 
 		 936 aa  1926    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5022  hypothetical protein  30.91 
 
 		 1042 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0503  hypothetical protein  31.28 
 
 		 1044 aa  198  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.778567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4586  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1047 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2615  cytotoxic necrotizing factor  22 
 
 		 1014 aa  92.4  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0504  hypothetical protein  23.95 
 
 		 882 aa  89  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5021  hypothetical protein  23.21 
 
 		 873 aa  89  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4938  hypothetical protein  28.46 
 
 		 716 aa  88.6  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5065  hypothetical protein  27.46 
 
 		 716 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714982  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  26.37 
 
 		 940 aa  66.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1269  hypothetical protein  20.77 
 
 		 848 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  0.53665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  24.76 
 
 		 927 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>