17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5021 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5021  hypothetical protein  100 
 
 		 873 aa  1806    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0504  hypothetical protein  81.88 
 
 		 882 aa  1477    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1269  hypothetical protein  37.03 
 
 		 848 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  0.53665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4586  hypothetical protein  35.69 
 
 		 1047 aa  345  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4938  hypothetical protein  34.14 
 
 		 716 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5065  hypothetical protein  34.62 
 
 		 716 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2615  cytotoxic necrotizing factor  22.05 
 
 		 1014 aa  108  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3656  hypothetical protein  23.21 
 
 		 936 aa  89  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5022  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1042 aa  84.7  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0503  hypothetical protein  25 
 
 		 1044 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.778567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3899  hypothetical protein  25.16 
 
 		 917 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.749066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0527  type III effector HopAC1  39.51 
 
 		 2042 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1537  hypothetical protein  23.38 
 
 		 903 aa  62  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0668197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4330  hypothetical protein  23.05 
 
 		 893 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557675 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4996  hypothetical protein  37.33 
 
 		 973 aa  58.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0881  hypothetical protein  26.98 
 
 		 258 aa  50.1  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02068  hypothetical protein  28.86 
 
 		 259 aa  46.2  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>