13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5065 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5065  hypothetical protein  100 
 
 		 716 aa  1455    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4938  hypothetical protein  90.36 
 
 		 716 aa  1326    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5021  hypothetical protein  34.62 
 
 		 873 aa  244  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0504  hypothetical protein  34.63 
 
 		 882 aa  232  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4586  hypothetical protein  31.08 
 
 		 1047 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1269  hypothetical protein  31.21 
 
 		 848 aa  180  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  0.53665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3656  hypothetical protein  27.46 
 
 		 936 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2615  cytotoxic necrotizing factor  21.52 
 
 		 1014 aa  77  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3899  hypothetical protein  24.84 
 
 		 917 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.749066  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4330  hypothetical protein  24.4 
 
 		 893 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557675 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1537  hypothetical protein  24.4 
 
 		 903 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0668197  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5022  hypothetical protein  21.1 
 
 		 1042 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0503  hypothetical protein  20.83 
 
 		 1044 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.778567 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>