17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2615 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2615  cytotoxic necrotizing factor  100 
 
 		 1014 aa  2053    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4586  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1047 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5021  hypothetical protein  22.05 
 
 		 873 aa  108  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1559  hypothetical protein  37.06 
 
 		 1133 aa  100  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000950021 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0504  hypothetical protein  21.52 
 
 		 882 aa  96.3  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3656  hypothetical protein  22 
 
 		 936 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1537  hypothetical protein  20.43 
 
 		 903 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0668197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1500  hypothetical protein  34 
 
 		 1140 aa  90.1  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.100715  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1775  hypothetical protein  34.17 
 
 		 610 aa  90.1  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.236701  normal  0.0800386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4330  hypothetical protein  20.43 
 
 		 893 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557675 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3899  hypothetical protein  21.41 
 
 		 917 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.749066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0503  hypothetical protein  20.47 
 
 		 1044 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.778567 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5022  hypothetical protein  19.34 
 
 		 1042 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5065  hypothetical protein  21.46 
 
 		 716 aa  71.6  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0134  hypothetical protein  27.81 
 
 		 403 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4938  hypothetical protein  26.62 
 
 		 716 aa  65.1  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1269  hypothetical protein  27.34 
 
 		 848 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  0.53665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>