18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5022 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5022  hypothetical protein  100 
 
 		 1042 aa  2150    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0503  hypothetical protein  80.08 
 
 		 1044 aa  1735    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.778567 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3656  hypothetical protein  30.91 
 
 		 936 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4330  hypothetical protein  29.72 
 
 		 893 aa  197  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557675 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3899  hypothetical protein  30.8 
 
 		 917 aa  197  9e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.749066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1537  hypothetical protein  29.52 
 
 		 903 aa  197  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0668197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4586  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1047 aa  98.6  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  30.34 
 
 		 927 aa  95.1  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5021  hypothetical protein  23.64 
 
 		 873 aa  84.7  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0504  hypothetical protein  22.58 
 
 		 882 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2615  cytotoxic necrotizing factor  19.34 
 
 		 1014 aa  78.6  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  27.27 
 
 		 940 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1269  hypothetical protein  22.13 
 
 		 848 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  0.53665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4938  hypothetical protein  21.9 
 
 		 716 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5065  hypothetical protein  21.1 
 
 		 716 aa  48.5  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714982  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1961  hypothetical protein  28.57 
 
 		 631 aa  47  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1955  hypothetical protein  26.98 
 
 		 631 aa  45.4  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3453  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1527 aa  44.7  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.173226 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>