13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4938 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5065  hypothetical protein  90.36 
 
 		 716 aa  1315    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4938  hypothetical protein  100 
 
 		 716 aa  1452    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5021  hypothetical protein  34.14 
 
 		 873 aa  238  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0504  hypothetical protein  34.37 
 
 		 882 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4586  hypothetical protein  30.33 
 
 		 1047 aa  170  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1269  hypothetical protein  30.26 
 
 		 848 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  0.53665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3656  hypothetical protein  28.46 
 
 		 936 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3899  hypothetical protein  26.17 
 
 		 917 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.749066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2615  cytotoxic necrotizing factor  26.62 
 
 		 1014 aa  65.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1537  hypothetical protein  23.66 
 
 		 903 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0668197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4330  hypothetical protein  23.66 
 
 		 893 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557675 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5022  hypothetical protein  21.9 
 
 		 1042 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0503  hypothetical protein  21.86 
 
 		 1044 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.778567 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>