15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0503 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5022  hypothetical protein  80.19 
 
 		 1042 aa  1761    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0503  hypothetical protein  100 
 
 		 1044 aa  2150    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.778567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3899  hypothetical protein  32.12 
 
 		 917 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.749066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3656  hypothetical protein  31.28 
 
 		 936 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4330  hypothetical protein  30.13 
 
 		 893 aa  195  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557675 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1537  hypothetical protein  30.28 
 
 		 903 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0668197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  28.87 
 
 		 927 aa  94  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4586  hypothetical protein  22.93 
 
 		 1047 aa  85.9  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2615  cytotoxic necrotizing factor  20.24 
 
 		 1014 aa  80.9  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0504  hypothetical protein  23.44 
 
 		 882 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5021  hypothetical protein  24.85 
 
 		 873 aa  74.7  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  26.13 
 
 		 940 aa  61.2  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5065  hypothetical protein  20.83 
 
 		 716 aa  46.2  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4938  hypothetical protein  21.86 
 
 		 716 aa  46.2  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3453  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1527 aa  46.2  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.173226 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>