17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4330 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3656  hypothetical protein  53.15 
 
 		 936 aa  960    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3899  hypothetical protein  60.07 
 
 		 917 aa  1070    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.749066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1537  hypothetical protein  98.88 
 
 		 903 aa  1815    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0668197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4330  hypothetical protein  100 
 
 		 893 aa  1836    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557675 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5022  hypothetical protein  29.72 
 
 		 1042 aa  198  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0503  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1044 aa  195  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.778567 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  26 
 
 		 927 aa  95.5  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4586  hypothetical protein  22.79 
 
 		 1047 aa  90.9  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2615  cytotoxic necrotizing factor  20.43 
 
 		 1014 aa  90.5  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0504  hypothetical protein  23.05 
 
 		 882 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  26.07 
 
 		 940 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5021  hypothetical protein  23.05 
 
 		 873 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3979  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1111 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4938  hypothetical protein  23.66 
 
 		 716 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5065  hypothetical protein  24.4 
 
 		 716 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1269  hypothetical protein  19.31 
 
 		 848 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  0.53665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4245  hypothetical protein  23.37 
 
 		 1111 aa  45.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.847999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>