17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3899 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3656  hypothetical protein  49.79 
 
 		 936 aa  901    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4330  hypothetical protein  60.07 
 
 		 893 aa  1041    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557675 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3899  hypothetical protein  100 
 
 		 917 aa  1889    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.749066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1537  hypothetical protein  59.96 
 
 		 903 aa  1050    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0668197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0503  hypothetical protein  32.12 
 
 		 1044 aa  207  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.778567 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5022  hypothetical protein  30.8 
 
 		 1042 aa  197  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4586  hypothetical protein  22.72 
 
 		 1047 aa  103  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2615  cytotoxic necrotizing factor  21.41 
 
 		 1014 aa  85.9  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0504  hypothetical protein  25.84 
 
 		 882 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  26.77 
 
 		 940 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5021  hypothetical protein  25.16 
 
 		 873 aa  72  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4938  hypothetical protein  26.17 
 
 		 716 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  25.51 
 
 		 927 aa  67.8  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5065  hypothetical protein  24.84 
 
 		 716 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714982  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4245  hypothetical protein  21.32 
 
 		 1111 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.847999  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3979  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1111 aa  47.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1269  hypothetical protein  20.73 
 
 		 848 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  0.53665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>