11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0413 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5119  hypothetical protein  65.16 
 
 
1076 aa  1399    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0413  hypothetical protein  100 
 
 
1074 aa  2182    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754384  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4855  hypothetical protein  29.03 
 
 
934 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0373  hypothetical protein  28.88 
 
 
928 aa  194  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.223606  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0348  hypothetical protein  27.62 
 
 
928 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.451074  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4425  hypothetical protein  20 
 
 
1148 aa  67  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.669526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4884  hypothetical protein  22.64 
 
 
768 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5059  hypothetical protein  24.76 
 
 
1565 aa  52  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5205  hypothetical protein  39.8 
 
 
1268 aa  50.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.613528  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  39.78 
 
 
956 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
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NC_010501  PputW619_0405  hypothetical protein  25.45 
 
 
1555 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.354945 
 
 
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