12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5119 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5119  hypothetical protein  100 
 
 		 1076 aa  2195    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0413  hypothetical protein  64.79 
 
 		 1074 aa  1362    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4855  hypothetical protein  26.58 
 
 		 934 aa  172  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0373  hypothetical protein  27.14 
 
 		 928 aa  166  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.223606  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0348  hypothetical protein  26.99 
 
 		 928 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.451074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4425  hypothetical protein  22.4 
 
 		 1148 aa  69.3  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.669526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4884  hypothetical protein  22.11 
 
 		 768 aa  66.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5059  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1565 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  32.28 
 
 		 956 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5060  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1571 aa  47.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4933  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1530 aa  45.1  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0405  hypothetical protein  23.58 
 
 		 1555 aa  45.1  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.354945 
 
 
-
 
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