19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6193 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6193  outer capsid protein Hoc  100 
 
 		 228 aa  460  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0637  hypothetical protein  35.34 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4057  hypothetical protein  47 
 
 		 910 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09170  hypothetical protein  35.53 
 
 		 808 aa  65.5  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887975  normal  0.329696 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3335  hypothetical protein  43.59 
 
 		 577 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304879  normal  0.237472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2527  protein of unknown function DUF1535  41.18 
 
 		 904 aa  60.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.776522  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4263  hypothetical protein  46.03 
 
 		 848 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4059  hypothetical protein  41.43 
 
 		 587 aa  52.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360369  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0373  hypothetical protein  41.43 
 
 		 496 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154623  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0719  hypothetical protein  41.18 
 
 		 818 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2481  hypothetical protein  30.77 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3167  S-layer domain-containing protein  37.35 
 
 		 637 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1686  gp11  33.33 
 
 		 152 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4127  YD repeat protein  33.68 
 
 		 2318 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1053  gp11  35.44 
 
 		 174 aa  42  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.321055  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1195  hypothetical protein  26.97 
 
 		 234 aa  42.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000320385 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3873  hypothetical protein  35.23 
 
 		 154 aa  42.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266806  normal  0.0341449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2886  major tail protein  26.58 
 
 		 238 aa  41.6  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146277 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2176  major tail protein  26.58 
 
 		 238 aa  41.6  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>