137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2201 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  54.75 
 
 		 634 aa  653    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3064  autotransporter-associated beta strand repeat protein  54.75 
 
 		 634 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.782614 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  100 
 
 		 641 aa  1299    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  52.51 
 
 		 657 aa  595  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  50.81 
 
 		 683 aa  581  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6344  beta strand repeat-containing protein  52.47 
 
 		 652 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  50.57 
 
 		 661 aa  561  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6047  beta strand repeat-containing protein  51.81 
 
 		 652 aa  561  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.649226 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6306  beta strand repeat-containing protein  52.12 
 
 		 653 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662487 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6465  beta strand repeat-containing protein  52.12 
 
 		 653 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.696651  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6700  beta strand repeat-containing protein  52.12 
 
 		 653 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162952 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  41.94 
 
 		 986 aa  345  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  41.4 
 
 		 995 aa  339  9e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  43.28 
 
 		 1053 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0033  autotransporter-associated beta strand repeat protein  48.14 
 
 		 348 aa  297  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.354567 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.34 
 
 		 1011 aa  267  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  40.1 
 
 		 1177 aa  247  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3788  putative phosphatase  35 
 
 		 423 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3969  putative phosphatase  35 
 
 		 423 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3908  putative phosphatase  35 
 
 		 423 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2492  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.89 
 
 		 425 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2395  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.1 
 
 		 465 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2222  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.73 
 
 		 447 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2536  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.97 
 
 		 431 aa  130  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0315  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  26.51 
 
 		 378 aa  95.5  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.32 
 
 		 1125 aa  92.8  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2001  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.05 
 
 		 378 aa  91.7  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  30.36 
 
 		 974 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  33 
 
 		 954 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  32.24 
 
 		 1028 aa  89  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0024  membrane-associated phospholipid phosphatase  29.78 
 
 		 510 aa  89  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0006  putative acid phosphatase  34.27 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  30.38 
 
 		 1055 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  32.17 
 
 		 1004 aa  79.7  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4861  phosphoesterase PA-phosphatase related  50.63 
 
 		 472 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  34.97 
 
 		 1038 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2954  autotransporter-associated beta strand repeat protein  40.48 
 
 		 947 aa  72  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154236  hitchhiker  0.00450699 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3763  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.62 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0690  Acid phosphatase  33.33 
 
 		 258 aa  69.7  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0243  putative acid phosphatase  32.26 
 
 		 249 aa  69.7  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  28.37 
 
 		 1062 aa  67.4  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  31.75 
 
 		 949 aa  67.4  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000000485293  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  38.3 
 
 		 1882 aa  66.6  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1849  Acid phosphatase  33.03 
 
 		 292 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1570  acid phosphatase  33.03 
 
 		 292 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  0.0585082 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  29.91 
 
 		 965 aa  65.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  31.75 
 
 		 970 aa  66.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  31.9 
 
 		 3322 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4538  acid phosphatase  38.18 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  31.6 
 
 		 970 aa  65.5  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1669  Acid phosphatase  29.23 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206276  normal  0.6113 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  31.6 
 
 		 998 aa  65.1  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.25 
 
 		 910 aa  63.9  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  33.33 
 
 		 1971 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03461  acid phosphatase  34.65 
 
 		 285 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.355106 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4100  acid phosphatase  30.33 
 
 		 295 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.122701 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  29.58 
 
 		 909 aa  63.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2218  hypothetical protein  30.22 
 
 		 709 aa  61.6  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1631  acid phosphatase  36 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00703  serine protease  28.39 
 
 		 911 aa  60.5  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2550  acid phosphatase  31.69 
 
 		 272 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.232354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2405  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.62 
 
 		 262 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.449401 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.52 
 
 		 1848 aa  58.9  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  36.62 
 
 		 2711 aa  58.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0038  Acid phosphatase  31.25 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17079  hitchhiker  0.000164539 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  27.99 
 
 		 1033 aa  58.5  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4695  acid phosphatase  30.16 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  36.09 
 
 		 1325 aa  58.2  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  40.96 
 
 		 2642 aa  58.2  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  42.17 
 
 		 2057 aa  57.4  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.05 
 
 		 1029 aa  57.4  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  30.11 
 
 		 1550 aa  57.4  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2221  acid phosphatase  34.23 
 
 		 283 aa  57  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517778  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3182  Acid phosphatase  30.36 
 
 		 248 aa  56.6  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0651896  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.97 
 
 		 915 aa  56.6  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  34.02 
 
 		 1782 aa  56.6  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00690  acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase  33.67 
 
 		 253 aa  56.2  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.53 
 
 		 906 aa  55.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.17 
 
 		 926 aa  55.5  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  35.51 
 
 		 1446 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1258  beta strand repeat-containing protein  36 
 
 		 550 aa  55.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.305666  normal  0.49742 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4589  putative acid phosphatase  34.65 
 
 		 250 aa  55.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.10693  normal  0.314355 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  41.46 
 
 		 2906 aa  55.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.11 
 
 		 1285 aa  54.3  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2143  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.36 
 
 		 256 aa  53.9  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  28.08 
 
 		 942 aa  53.9  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  41.3 
 
 		 1530 aa  53.9  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  38.05 
 
 		 1741 aa  53.5  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4585  putative acid phosphatase  34.74 
 
 		 250 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4714  putative acid phosphatase  34.74 
 
 		 250 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4680  putative acid phosphatase  33.66 
 
 		 250 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.29 
 
 		 913 aa  53.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4670  putative acid phosphatase  33.68 
 
 		 250 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  39.76 
 
 		 3506 aa  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03490  phosphatase  27.72 
 
 		 265 aa  50.4  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  42.19 
 
 		 1113 aa  50.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.99 
 
 		 174 aa  50.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  33.12 
 
 		 1006 aa  50.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  46.3 
 
 		 1357 aa  50.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  45.76 
 
 		 1532 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>