27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1329 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1329  outer membrane autotransporter  100 
 
 
1058 aa  2064    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0892684  normal  0.563685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4552  autotransporter beta-domain-containing protein  30.86 
 
 
1097 aa  363  1e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.518565 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1503  autotransporter beta-domain-containing protein  30.11 
 
 
1069 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662364  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1109  autotransporter beta-domain-containing protein  28.98 
 
 
1071 aa  273  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0545  Outer membrane autotransporter barrel protein  29.45 
 
 
1058 aa  248  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  25.18 
 
 
1769 aa  75.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4997  Outer membrane autotransporter barrel  26.61 
 
 
998 aa  67.4  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  23.24 
 
 
1369 aa  65.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.14 
 
 
1489 aa  66.2  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.18 
 
 
919 aa  63.9  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0245  Outer membrane autotransporter barrel  25.81 
 
 
2175 aa  61.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203155  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  24.73 
 
 
939 aa  55.8  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  24.15 
 
 
1068 aa  53.1  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  22.83 
 
 
816 aa  51.6  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1095  outer membrane autotransporter  22.86 
 
 
10429 aa  50.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  24.59 
 
 
1782 aa  50.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  22.65 
 
 
1119 aa  49.7  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  21.81 
 
 
1519 aa  49.3  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.63 
 
 
1227 aa  48.5  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.76 
 
 
774 aa  48.1  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  22.48 
 
 
1025 aa  47.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  24.6 
 
 
1333 aa  46.6  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1981  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.38 
 
 
1242 aa  46.2  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1155  autotransporter domain-containing protein  21.71 
 
 
1677 aa  45.1  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1533  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.54 
 
 
1251 aa  45.1  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  24.06 
 
 
2848 aa  45.1  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  28.34 
 
 
1130 aa  44.7  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>