51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0725 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0725  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 		 3504 aa  7009    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0571  Outer membrane autotransporter barrel  37.13 
 
 		 452 aa  216  7.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12161  hypothetical protein  28.24 
 
 		 531 aa  112  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.732574  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12321  hypothetical protein  28.57 
 
 		 523 aa  112  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0181864  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  28.78 
 
 		 3089 aa  70.5  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.23 
 
 		 1532 aa  70.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  29.17 
 
 		 1971 aa  69.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  26.94 
 
 		 2642 aa  64.7  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  29.63 
 
 		 1108 aa  62.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.12 
 
 		 1134 aa  61.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  27.11 
 
 		 2711 aa  60.5  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  28.99 
 
 		 2906 aa  58.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  28.41 
 
 		 994 aa  57.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  31.48 
 
 		 1019 aa  57  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  26.98 
 
 		 1156 aa  56.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  26.43 
 
 		 1369 aa  55.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  29.01 
 
 		 1861 aa  55.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16161  hypothetical protein  61.76 
 
 		 41 aa  55.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  29.01 
 
 		 2578 aa  53.9  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  25.13 
 
 		 1882 aa  52.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  30.35 
 
 		 1459 aa  53.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  30.53 
 
 		 2407 aa  52.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  29.63 
 
 		 1458 aa  52  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  34.88 
 
 		 4238 aa  52  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  30 
 
 		 1508 aa  51.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  32.18 
 
 		 950 aa  50.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  30.36 
 
 		 3415 aa  50.8  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  30.82 
 
 		 1130 aa  51.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  30.46 
 
 		 1111 aa  50.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  31.87 
 
 		 1180 aa  50.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  26 
 
 		 1179 aa  50.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  34.57 
 
 		 2057 aa  50.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  30.36 
 
 		 3420 aa  50.1  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  26.88 
 
 		 1154 aa  50.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  31.07 
 
 		 3391 aa  49.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  28.65 
 
 		 1806 aa  49.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  28.65 
 
 		 1632 aa  49.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.93 
 
 		 3629 aa  49.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  30.34 
 
 		 1066 aa  49.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  25.53 
 
 		 1113 aa  48.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  30.86 
 
 		 2926 aa  48.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  30.91 
 
 		 852 aa  48.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1588  Outer membrane autotransporter barrel  23.68 
 
 		 1184 aa  48.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  30.04 
 
 		 1172 aa  48.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  35.04 
 
 		 4238 aa  47.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.19 
 
 		 1322 aa  47.4  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  35.04 
 
 		 3822 aa  47  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  29.82 
 
 		 1119 aa  46.6  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  28.15 
 
 		 1530 aa  46.6  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  25.81 
 
 		 2003 aa  46.6  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.91 
 
 		 1029 aa  46.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>