12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0571 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0571  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 		 452 aa  932    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0725  Outer membrane autotransporter barrel  38.99 
 
 		 3504 aa  221  3e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12161  hypothetical protein  20.27 
 
 		 531 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.732574  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12321  hypothetical protein  20.27 
 
 		 523 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0181864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  27.19 
 
 		 1369 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  24.02 
 
 		 994 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  24.69 
 
 		 985 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  36.25 
 
 		 1066 aa  47  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16161  hypothetical protein  52.94 
 
 		 41 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1132  outer membrane autotransporter  33.33 
 
 		 825 aa  45.1  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  26.24 
 
 		 854 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  30.7 
 
 		 1222 aa  44.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>