25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_1132 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1132  outer membrane autotransporter  100 
 
 
825 aa  1670    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1133  outer membrane autotransporter  43.64 
 
 
1058 aa  451  1e-125  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1109  outer membrane autotransporter  31.68 
 
 
1193 aa  339  9.999999999999999e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  23.06 
 
 
1067 aa  65.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  24.75 
 
 
820 aa  59.7  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  22.64 
 
 
1070 aa  56.6  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  23.13 
 
 
3322 aa  52  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  28.25 
 
 
1277 aa  52  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  23.82 
 
 
1753 aa  51.6  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  22.11 
 
 
1070 aa  51.6  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  24.53 
 
 
1861 aa  50.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  25.97 
 
 
2578 aa  50.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  25.97 
 
 
2906 aa  49.3  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.36 
 
 
1055 aa  49.3  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  22.41 
 
 
1748 aa  48.5  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  23.94 
 
 
1108 aa  47.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  25.58 
 
 
1049 aa  45.8  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  26.47 
 
 
818 aa  45.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  27.01 
 
 
1093 aa  44.7  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  28.76 
 
 
1099 aa  45.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  27.01 
 
 
1093 aa  44.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0571  Outer membrane autotransporter barrel  33.33 
 
 
452 aa  44.3  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  30.32 
 
 
1115 aa  44.3  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2537  autotransporter beta-domain-containing protein  27.27 
 
 
356 aa  44.3  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686468  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  22.28 
 
 
1113 aa  44.3  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>