14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_1109 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1109  outer membrane autotransporter  100 
 
 
1193 aa  2414    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1132  outer membrane autotransporter  35.91 
 
 
825 aa  337  9e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1133  outer membrane autotransporter  33.66 
 
 
1058 aa  300  9e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1110  hypothetical protein  37.5 
 
 
636 aa  92.8  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.11077  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  26.45 
 
 
818 aa  53.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  35.92 
 
 
950 aa  51.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  26.95 
 
 
909 aa  51.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  27.5 
 
 
825 aa  49.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  29.14 
 
 
1741 aa  49.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  27.86 
 
 
819 aa  49.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.85 
 
 
1009 aa  47.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.17 
 
 
1055 aa  46.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  29.88 
 
 
927 aa  45.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0902  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.12 
 
 
2358 aa  45.4  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>