15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1826 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1826  outer membrane protein  100 
 
 
190 aa  374  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400541  normal  0.391918 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  59.12 
 
 
2407 aa  159  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  56.06 
 
 
814 aa  148  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  51.88 
 
 
1130 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  50.71 
 
 
987 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  52.63 
 
 
1081 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  48.23 
 
 
1180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  51.88 
 
 
1111 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  48.48 
 
 
1019 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  46.62 
 
 
907 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  42.14 
 
 
1078 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  45.86 
 
 
882 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  41.22 
 
 
1177 aa  92.8  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  37.41 
 
 
678 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.39 
 
 
1532 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>