28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0204 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  48.58 
 
 		 870 aa  708    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1220  outer membrane autotransporter barrel domain protein  50.06 
 
 		 863 aa  752    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0823  outer membrane autotransporter barrel domain protein  64.27 
 
 		 855 aa  1073    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0822  outer membrane autotransporter barrel domain protein  47.59 
 
 		 854 aa  707    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0204  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 		 857 aa  1704    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  21.52 
 
 		 2637 aa  63.9  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.94 
 
 		 868 aa  62.4  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  21.84 
 
 		 1806 aa  55.5  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  22.37 
 
 		 466 aa  55.1  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  22.51 
 
 		 1327 aa  55.1  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  21.15 
 
 		 4391 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  20.91 
 
 		 4312 aa  52.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.36 
 
 		 1023 aa  50.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  24.77 
 
 		 955 aa  50.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  24.77 
 
 		 955 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0916  outer membrane autotransporter  26.6 
 
 		 1144 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.753371 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  21.77 
 
 		 836 aa  47.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  21.77 
 
 		 836 aa  47.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  21.77 
 
 		 863 aa  47.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  21.77 
 
 		 863 aa  47.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.77 
 
 		 836 aa  47.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  24.77 
 
 		 997 aa  47  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  24.43 
 
 		 773 aa  45.4  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  25.37 
 
 		 1579 aa  45.4  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  22.36 
 
 		 1102 aa  45.1  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.87 
 
 		 1357 aa  44.7  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  24.27 
 
 		 1004 aa  45.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  23.61 
 
 		 1594 aa  44.3  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>