13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0259 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0259  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 		 940 aa  1826    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.76 
 
 		 1197 aa  247  6.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  28.44 
 
 		 1971 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  32.63 
 
 		 2198 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  33.63 
 
 		 3954 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0204  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.35 
 
 		 857 aa  52.4  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.2 
 
 		 870 aa  51.6  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  31.67 
 
 		 825 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1511  outer membrane autotransporter  27.59 
 
 		 1886 aa  47.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  31.58 
 
 		 914 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0822  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.45 
 
 		 854 aa  47  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  31.67 
 
 		 819 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0823  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22 
 
 		 855 aa  45.8  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>