39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3335 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3649  MSHA biogenesis protein MshQ  48.84 
 
 		 1248 aa  889    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.516469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4403  hypothetical protein  44.13 
 
 		 1463 aa  1066    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0517  hypothetical protein  52.5 
 
 		 1543 aa  1432    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0496  hypothetical protein  52.5 
 
 		 1543 aa  1425    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0848067  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0573  MSHA biogenesis protein MshQ  48.84 
 
 		 1258 aa  894    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0117136  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3823  hypothetical protein  52.05 
 
 		 1541 aa  1424    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.473732  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3739  hypothetical protein  58.94 
 
 		 1532 aa  1637    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0478  MSHA biogenesis protein MshQ  49.2 
 
 		 1255 aa  906    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233703  normal  0.793103 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3473  MSHA biogenesis protein MshQ  49.5 
 
 		 1261 aa  901    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.928372 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3335  hypothetical protein  100 
 
 		 1553 aa  3196    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.545908  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4100  MSHA biogenesis protein MshQ  54.36 
 
 		 1257 aa  1019    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0521  hypothetical protein  52.26 
 
 		 1543 aa  1427    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.402104 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0466  MSHA biogenesis protein MshQ  47.65 
 
 		 837 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0264284  normal  0.812437 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2833  hypothetical protein  37.75 
 
 		 1252 aa  610  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000270915  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002382  hypothetical protein  29.54 
 
 		 1508 aa  327  9e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0557  MSHA biogenesis protein MshQ  28.01 
 
 		 906 aa  248  4.9999999999999997e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0109211  normal  0.590942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0402  MSHA biogenesis protein MshQ  29.83 
 
 		 900 aa  247  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0473177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3755  PA14 domain-containing protein  29.65 
 
 		 1382 aa  245  6e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0111574  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  30.42 
 
 		 1072 aa  234  9e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  30.11 
 
 		 1306 aa  221  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1504 aa  218  8e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0888  hypothetical protein  42.11 
 
 		 1191 aa  206  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.199681 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3337  hypothetical protein  43.57 
 
 		 1202 aa  202  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3101  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1133 aa  169  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00263  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshQ (pilus type IV)  27.26 
 
 		 1168 aa  168  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0765  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1085 aa  137  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232029  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03686  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1544 aa  129  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  33.93 
 
 		 2642 aa  124  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1576 aa  122  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  36.84 
 
 		 900 aa  116  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0182  CUB domain-containing protein  22.35 
 
 		 1537 aa  94.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384689  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  31.2 
 
 		 4896 aa  89.4  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_003296  RS05333  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  26.86 
 
 		 1111 aa  83.2  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.476781 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0192  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  26.94 
 
 		 1127 aa  75.1  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.48482 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  26.55 
 
 		 907 aa  64.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  27.9 
 
 		 3911 aa  64.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05444  hypothetical protein  22.73 
 
 		 793 aa  63.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001507  MSHA biogenesis protein MshQ  23.05 
 
 		 1008 aa  57.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.101461  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  23.53 
 
 		 1066 aa  53.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>