16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4916 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4916  hypothetical protein  100 
 
 		 2650 aa  5106    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0838  hypothetical protein  30.25 
 
 		 1046 aa  186  7e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0835  hypothetical protein  31.12 
 
 		 1084 aa  173  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0837  hypothetical protein  30.17 
 
 		 1184 aa  156  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0839  hypothetical protein  28.73 
 
 		 1331 aa  151  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0834  CHU large protein  26.98 
 
 		 909 aa  140  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  28.36 
 
 		 2416 aa  133  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0878  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1051 aa  80.5  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.599854 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0873  CHU large protein  26.07 
 
 		 1053 aa  80.1  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.539179 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10753  putative membrane-anchored cell surface protein  29.08 
 
 		 827 aa  72.4  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00625  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1083 aa  61.6  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.733753  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3296  hypothetical protein  22.7 
 
 		 599 aa  54.3  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1280 aa  50.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3740  hypothetical protein  29.26 
 
 		 1054 aa  49.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3337  hypothetical protein  32.43 
 
 		 1202 aa  47.4  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0806  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1351 aa  47  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>