25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10753 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_10753  putative membrane-anchored cell surface protein  100 
 
 
827 aa  1644    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00625  hypothetical protein  34.83 
 
 
1083 aa  303  9e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.733753  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3740  hypothetical protein  26.36 
 
 
1054 aa  95.1  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4916  hypothetical protein  29.08 
 
 
2650 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284664 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  36.67 
 
 
654 aa  68.2  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  39.77 
 
 
617 aa  61.6  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5097  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  35.9 
 
 
727 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02230  metalloprotease, putative  35.48 
 
 
927 aa  59.7  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493351  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  40.51 
 
 
1154 aa  58.5  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  37.76 
 
 
1441 aa  52.4  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05045  putative alpha-amylase  35.65 
 
 
937 aa  51.6  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.408257  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2150  hypothetical protein  40.91 
 
 
356 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0049  hypothetical protein  30.51 
 
 
1449 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000651101  normal  0.0482632 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  27.31 
 
 
2416 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09243  hypothetical protein  32.97 
 
 
1031 aa  50.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.100624  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0411  hemagglutinin, putative  31.65 
 
 
925 aa  47.8  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04405  hypothetical protein  39.47 
 
 
469 aa  47.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2248  hypothetical protein  31.37 
 
 
549 aa  47  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5215  hypothetical protein  28 
 
 
173 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0547  hypothetical protein  31.65 
 
 
112 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08596  hypothetical protein  28.23 
 
 
659 aa  46.2  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.53584  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  34.74 
 
 
1187 aa  45.8  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  34.18 
 
 
2160 aa  45.4  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1071  metalloprotease  28.75 
 
 
425 aa  44.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3296  hypothetical protein  23.1 
 
 
599 aa  44.3  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>