14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0411 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0411  hemagglutinin, putative  100 
 
 		 925 aa  1907    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1837  hemagglutinin protein HagA  34.06 
 
 		 2105 aa  244  5e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1326  hemagglutinin, putative  44.75 
 
 		 352 aa  147  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2024  hemagglutinin protein HagE  47.06 
 
 		 1706 aa  137  8e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.044838 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04405  hypothetical protein  29.55 
 
 		 469 aa  49.7  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10753  putative membrane-anchored cell surface protein  31.65 
 
 		 827 aa  47.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1427  thiol protease/hemagglutinin PrtT precursor, putative  31.76 
 
 		 843 aa  46.6  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.491886 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05045  putative alpha-amylase  27.59 
 
 		 937 aa  45.8  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.408257  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  33.77 
 
 		 1063 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  43.86 
 
 		 933 aa  45.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3105  hypothetical protein  27.43 
 
 		 787 aa  45.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.667845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  31.25 
 
 		 1433 aa  44.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  30.88 
 
 		 665 aa  44.7  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  32.5 
 
 		 887 aa  44.7  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>