14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5215 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5215  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  353  7.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1308  hypothetical protein  43.33 
 
 
217 aa  117  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  36.25 
 
 
287 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5053  hypothetical protein  32.47 
 
 
533 aa  47.8  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22192  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08391  hypothetical protein  33.77 
 
 
353 aa  47  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10753  putative membrane-anchored cell surface protein  28 
 
 
827 aa  46.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  26.76 
 
 
1969 aa  45.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  33.68 
 
 
1093 aa  45.4  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3364  hypothetical protein  27.47 
 
 
565 aa  44.3  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.752802  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  29.87 
 
 
763 aa  43.9  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  31.25 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5463  hypothetical protein  34.57 
 
 
884 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  31.63 
 
 
908 aa  41.6  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0804  hypothetical protein  29.41 
 
 
946 aa  40.8  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.771937  normal  0.0719166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>