33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0547 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0547  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  227  5e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  42.25 
 
 
654 aa  69.3  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  35.71 
 
 
1093 aa  48.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02230  metalloprotease, putative  35.06 
 
 
927 aa  48.5  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493351  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5097  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  32.05 
 
 
727 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  38.96 
 
 
613 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10753  putative membrane-anchored cell surface protein  31.65 
 
 
827 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  31.87 
 
 
2160 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  36 
 
 
617 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  32.39 
 
 
615 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  38.03 
 
 
1108 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  35.62 
 
 
726 aa  44.3  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04145  metalloprotease, putative  31.58 
 
 
935 aa  44.7  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.18498  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  32.35 
 
 
1243 aa  44.3  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1456  hypothetical protein  29.59 
 
 
1024 aa  43.9  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00611896  normal  0.0757666 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2150  hypothetical protein  31.51 
 
 
356 aa  43.9  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04405  hypothetical protein  43.06 
 
 
469 aa  43.9  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0980  hypothetical protein  33.78 
 
 
859 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.266991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  29.7 
 
 
981 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  28.21 
 
 
365 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  29.33 
 
 
669 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4545  hypothetical protein  35.06 
 
 
772 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.402962  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  34.78 
 
 
1441 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2185  beta and gamma crystallin  32.43 
 
 
483 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421381  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3021  hypothetical protein  31.08 
 
 
244 aa  41.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07565  thermolysin  33.75 
 
 
1251 aa  41.6  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  33.33 
 
 
491 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  28.57 
 
 
1003 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0902  hypothetical protein  29.17 
 
 
545 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.440975  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  26.96 
 
 
1656 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03265  hypothetical protein  33.33 
 
 
528 aa  40.8  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0507671  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  30.63 
 
 
1002 aa  40.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03270  hypothetical protein  27.63 
 
 
1070 aa  40.4  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.88849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>