237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3915 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 713 aa  1476    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  61.93 
 
 		 940 aa  229  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  56.32 
 
 		 945 aa  201  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  52.41 
 
 		 948 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  48.88 
 
 		 944 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.89 
 
 		 942 aa  172  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  53.93 
 
 		 948 aa  167  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  53.37 
 
 		 948 aa  167  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  53.37 
 
 		 948 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  50 
 
 		 944 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  49.4 
 
 		 944 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  49.4 
 
 		 944 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.19 
 
 		 944 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.86 
 
 		 955 aa  144  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.77 
 
 		 947 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  37.3 
 
 		 816 aa  93.2  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  43.75 
 
 		 823 aa  92  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  51.11 
 
 		 780 aa  91.7  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  35.58 
 
 		 1027 aa  91.7  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  41.86 
 
 		 918 aa  90.9  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  38.61 
 
 		 677 aa  90.9  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  47.06 
 
 		 777 aa  90.1  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  39.76 
 
 		 623 aa  88.2  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  35.43 
 
 		 1565 aa  84.3  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  38.65 
 
 		 1057 aa  84.3  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  37.82 
 
 		 1150 aa  81.3  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  45.24 
 
 		 778 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  45.24 
 
 		 778 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  45.24 
 
 		 778 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  45.24 
 
 		 778 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  42.86 
 
 		 1151 aa  79  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  47.56 
 
 		 775 aa  79  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  48.81 
 
 		 1916 aa  78.2  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  36.69 
 
 		 840 aa  77.4  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  32.82 
 
 		 873 aa  76.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  33.82 
 
 		 971 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 		 1158 aa  73.9  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  35 
 
 		 2066 aa  73.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  31.87 
 
 		 818 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  32.52 
 
 		 971 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  32.52 
 
 		 971 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  32.52 
 
 		 971 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  32.52 
 
 		 1018 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  29.87 
 
 		 1154 aa  71.6  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  29.77 
 
 		 3197 aa  71.2  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  32.52 
 
 		 971 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  34.94 
 
 		 792 aa  71.2  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  33.65 
 
 		 971 aa  70.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  32.2 
 
 		 971 aa  70.5  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.15 
 
 		 836 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.08 
 
 		 835 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  34.62 
 
 		 971 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  28.29 
 
 		 3197 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  33.18 
 
 		 971 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  43.43 
 
 		 967 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  39.78 
 
 		 938 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.91 
 
 		 699 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  44.71 
 
 		 814 aa  68.2  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.25 
 
 		 835 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.45 
 
 		 835 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  31.21 
 
 		 517 aa  67.8  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  53.75 
 
 		 774 aa  66.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  35.25 
 
 		 1601 aa  66.6  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.77 
 
 		 913 aa  65.9  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  43.96 
 
 		 965 aa  65.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  43.96 
 
 		 965 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  43.96 
 
 		 965 aa  65.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  39.42 
 
 		 712 aa  64.7  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  32.02 
 
 		 965 aa  64.7  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  32.68 
 
 		 552 aa  64.7  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  43.42 
 
 		 1104 aa  64.3  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  43.42 
 
 		 1104 aa  64.3  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  42.86 
 
 		 965 aa  63.9  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  42.86 
 
 		 965 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  42.86 
 
 		 965 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  30.99 
 
 		 1732 aa  63.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0135  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  42.68 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.73051  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  41.76 
 
 		 965 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  42.35 
 
 		 943 aa  62.4  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  34 
 
 		 734 aa  62.4  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  29.73 
 
 		 735 aa  62  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  41.98 
 
 		 820 aa  62  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  40.66 
 
 		 965 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0611  putative microbial collagenase  39.56 
 
 		 965 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  37.93 
 
 		 861 aa  61.2  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0980  hypothetical protein  23.79 
 
 		 859 aa  61.2  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.266991 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  32.59 
 
 		 1095 aa  60.8  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5250  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.78 
 
 		 467 aa  60.1  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.41 
 
 		 773 aa  60.1  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.78 
 
 		 1200 aa  59.3  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00625  hypothetical protein  30.71 
 
 		 1083 aa  60.1  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.733753  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  26.67 
 
 		 1361 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  32.33 
 
 		 1120 aa  59.3  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0573  PKD domain containing protein  29 
 
 		 1084 aa  59.7  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.179888  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  32 
 
 		 561 aa  59.3  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  29.77 
 
 		 2554 aa  58.9  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  33.58 
 
 		 547 aa  59.3  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  29.09 
 
 		 1300 aa  58.5  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  31.3 
 
 		 3295 aa  58.5  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>