101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0165 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0165  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 848 aa  1734    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.748884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  53.41 
 
 		 820 aa  90.5  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  53.66 
 
 		 652 aa  89  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1682 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 551 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.32 
 
 		 639 aa  78.2  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  27.05 
 
 		 2122 aa  77.8  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1049  hypothetical protein  43.33 
 
 		 599 aa  71.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17037  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1053  hypothetical protein  40.66 
 
 		 514 aa  71.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  26.9 
 
 		 486 aa  70.1  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.65 
 
 		 940 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  42.86 
 
 		 758 aa  64.7  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  25.07 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  25.93 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  24.78 
 
 		 322 aa  62.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  25.07 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 		 963 aa  62  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  32.24 
 
 		 1030 aa  60.1  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 		 463 aa  59.7  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  24.27 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  24.32 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  41.86 
 
 		 1756 aa  57.8  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2204  Pyrrolo-quinoline quinone  26.11 
 
 		 444 aa  56.6  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04330  putative carbohydrate-binding protein with Ig-like domain and F5/8 type C domain  35.64 
 
 		 1197 aa  56.2  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.647548 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  27.51 
 
 		 475 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  44.78 
 
 		 1937 aa  55.8  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  41.1 
 
 		 1467 aa  55.5  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0148  alpha amylase catalytic region  42.11 
 
 		 878 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0174055 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1171  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  40.74 
 
 		 788 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  20 
 
 		 439 aa  53.9  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  29.73 
 
 		 2036 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  24.38 
 
 		 795 aa  53.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1107  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  40.74 
 
 		 788 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  23.5 
 
 		 611 aa  52.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  26.89 
 
 		 448 aa  52.4  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  41.98 
 
 		 788 aa  52  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  40.48 
 
 		 1226 aa  52.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0988  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.98 
 
 		 788 aa  52  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  24.71 
 
 		 384 aa  51.6  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.09 
 
 		 402 aa  52  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  26.32 
 
 		 1454 aa  52  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  24.71 
 
 		 384 aa  51.6  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  24.14 
 
 		 556 aa  51.6  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  22.55 
 
 		 390 aa  51.2  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3882  hypothetical protein  35.37 
 
 		 113 aa  51.2  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0992  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.74 
 
 		 788 aa  51.2  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511049  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  36.05 
 
 		 793 aa  51.2  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  40.74 
 
 		 788 aa  51.2  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4198  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  40 
 
 		 788 aa  51.2  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  22.51 
 
 		 687 aa  50.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  40.74 
 
 		 788 aa  50.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487379  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.74 
 
 		 788 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  22.89 
 
 		 392 aa  49.7  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  43.55 
 
 		 384 aa  50.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1712  hypothetical protein  25.81 
 
 		 807 aa  50.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0116958  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1444  hypothetical protein  34.33 
 
 		 807 aa  50.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.239906  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  31.87 
 
 		 569 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  23.12 
 
 		 431 aa  49.7  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  38.33 
 
 		 14944 aa  49.3  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  24.2 
 
 		 387 aa  48.9  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1484  hypothetical protein  35.16 
 
 		 1128 aa  48.9  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.848457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  42.67 
 
 		 1951 aa  48.9  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4198  alpha amylase catalytic region  31.18 
 
 		 878 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  27.08 
 
 		 454 aa  48.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  24.62 
 
 		 365 aa  48.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.6 
 
 		 1383 aa  47.8  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  23.51 
 
 		 383 aa  47.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  37.18 
 
 		 576 aa  47.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  31.43 
 
 		 1351 aa  47  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.78 
 
 		 392 aa  47  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.56 
 
 		 393 aa  47  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3387  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  21.55 
 
 		 380 aa  47  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.94 
 
 		 393 aa  47.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  24.06 
 
 		 705 aa  47.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  23.56 
 
 		 901 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  24.02 
 
 		 397 aa  47.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  46.97 
 
 		 1825 aa  46.6  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.26 
 
 		 790 aa  46.6  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.889432  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.17 
 
 		 386 aa  46.6  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4158  alpha amylase catalytic region  30.11 
 
 		 878 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.32 
 
 		 393 aa  46.6  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  23.61 
 
 		 469 aa  46.6  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3619  Pyrrolo-quinoline quinone  23.62 
 
 		 581 aa  47  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  23.38 
 
 		 381 aa  46.2  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  23.38 
 
 		 381 aa  45.8  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  37.93 
 
 		 621 aa  45.8  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  22.61 
 
 		 457 aa  46.2  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  27.34 
 
 		 382 aa  46.2  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  20.13 
 
 		 455 aa  45.8  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  23.38 
 
 		 381 aa  45.8  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  23.38 
 
 		 381 aa  45.8  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25 
 
 		 381 aa  45.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.38 
 
 		 381 aa  45.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.38 
 
 		 350 aa  45.8  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  34.12 
 
 		 716 aa  45.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  23.81 
 
 		 352 aa  45.4  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  31.11 
 
 		 1916 aa  45.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.75 
 
 		 414 aa  44.7  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  31.94 
 
 		 702 aa  44.7  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  31.76 
 
 		 1052 aa  44.3  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>