49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0842 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  100 
 
 		 535 aa  1093    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  28.83 
 
 		 487 aa  181  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  27.04 
 
 		 494 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  33.76 
 
 		 789 aa  136  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  33.85 
 
 		 820 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4188  peptidase C1A papain  35.39 
 
 		 599 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  30.45 
 
 		 1628 aa  95.1  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1773  hypothetical protein  30.29 
 
 		 718 aa  93.6  8e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00222697 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0145  hypothetical protein  30 
 
 		 712 aa  93.2  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3515  peptidase C1A papain  28.77 
 
 		 307 aa  90.9  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.071303  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  29.1 
 
 		 1242 aa  85.9  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  27.57 
 
 		 1332 aa  81.6  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  32.35 
 
 		 619 aa  81.3  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  31.54 
 
 		 812 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04739  cysteine protease  25.45 
 
 		 270 aa  69.7  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  27.73 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  27.42 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04730  cysteine protease  24.09 
 
 		 312 aa  65.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0404654  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  29.72 
 
 		 1202 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  25.11 
 
 		 255 aa  62  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  25.63 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  25.63 
 
 		 271 aa  62  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  25.11 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1673  peptidase C1A, papain  27.43 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00360531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  24.54 
 
 		 272 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  25.64 
 
 		 1066 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0559  peptidase C1A papain  26.11 
 
 		 2353 aa  58.5  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.735343  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  24.57 
 
 		 1092 aa  58.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  47.89 
 
 		 814 aa  55.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  26.24 
 
 		 934 aa  55.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3867  peptidase C1A papain  27 
 
 		 640 aa  54.3  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3866  peptidase C1A papain  26.98 
 
 		 284 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401195  normal  0.15996 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1250  peptidase C1A papain  25.37 
 
 		 477 aa  54.3  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0216738  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0903  peptidase C1A, papain  38.24 
 
 		 496 aa  52  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0222  peptidase C1A, papain  41.51 
 
 		 497 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107237  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03990  peptidase C1A, papain  25.51 
 
 		 592 aa  48.5  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1038  hypothetical protein  24.66 
 
 		 475 aa  48.5  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  48.98 
 
 		 725 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4065  peptidase C1A, papain  35.53 
 
 		 224 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.561338 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50321  predicted protein  26.48 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  38.33 
 
 		 1236 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  42.59 
 
 		 354 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1306  peptidase C1A, papain  24.77 
 
 		 688 aa  44.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0209237  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  43.75 
 
 		 307 aa  44.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.9 
 
 		 1085 aa  44.3  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2675  hypothetical protein  23.4 
 
 		 353 aa  44.3  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  25 
 
 		 303 aa  43.9  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2675  hypothetical protein  26.51 
 
 		 688 aa  43.5  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0181  cysteine aminopeptidase  47.92 
 
 		 436 aa  43.5  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000920925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>