51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6088 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  100 
 
 		 395 aa  820    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  45.75 
 
 		 305 aa  248  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  39.93 
 
 		 307 aa  202  7e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  38.03 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0109  peptidase C1A papain  37.18 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0130  peptidase C1A papain  40.08 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0734  cysteine protease  38.37 
 
 		 323 aa  186  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  28.52 
 
 		 255 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  28.03 
 
 		 255 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  30.43 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  30.43 
 
 		 271 aa  103  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  29.26 
 
 		 272 aa  92.8  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2646  peptidase C1A papain  28.68 
 
 		 268 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  25.93 
 
 		 934 aa  82.8  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0783  hypothetical protein  39.84 
 
 		 153 aa  81.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0754  hypothetical protein  37.4 
 
 		 153 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1250  peptidase C1A papain  28.79 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0216738  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3866  peptidase C1A papain  29.41 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401195  normal  0.15996 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  27.73 
 
 		 535 aa  68.6  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2509  hypothetical protein  27.11 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  23.55 
 
 		 820 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04730  cysteine protease  23.33 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0404654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04739  cysteine protease  22.92 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2639  hypothetical protein  27.11 
 
 		 364 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1306  peptidase C1A, papain  25.89 
 
 		 688 aa  54.3  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0209237  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  25.2 
 
 		 494 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2675  hypothetical protein  23.7 
 
 		 688 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3867  peptidase C1A papain  23.83 
 
 		 640 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  26.21 
 
 		 1236 aa  51.2  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3580  hypothetical protein  21.71 
 
 		 753 aa  50.1  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.28463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  27.16 
 
 		 1066 aa  50.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2994  peptidase C1A papain  23.83 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.766742  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  25.79 
 
 		 619 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0222  peptidase C1A, papain  43.14 
 
 		 497 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107237  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  25.78 
 
 		 1242 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0903  peptidase C1A, papain  43.14 
 
 		 496 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3607  peptidase C1A papain  23.96 
 
 		 270 aa  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  23.83 
 
 		 812 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  24.9 
 
 		 789 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3515  peptidase C1A papain  22.41 
 
 		 307 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.071303  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  24.37 
 
 		 1628 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  25.84 
 
 		 870 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4065  peptidase C1A, papain  25.22 
 
 		 224 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.561338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  27.97 
 
 		 354 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  36.36 
 
 		 487 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  25.65 
 
 		 725 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2547  hypothetical protein  20.29 
 
 		 353 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2675  hypothetical protein  20.29 
 
 		 353 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1038  hypothetical protein  33.02 
 
 		 475 aa  43.5  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  33.33 
 
 		 814 aa  43.1  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  22.62 
 
 		 1092 aa  42.7  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>