23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03990 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03990  peptidase C1A, papain  100 
 
 		 592 aa  1239    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3867  peptidase C1A papain  35.66 
 
 		 640 aa  344  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2675  hypothetical protein  32.84 
 
 		 688 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1306  peptidase C1A, papain  32.75 
 
 		 688 aa  283  9e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0209237  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3580  hypothetical protein  32.11 
 
 		 753 aa  253  6e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.28463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3428  hypothetical protein  32.45 
 
 		 652 aa  226  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3073  hypothetical protein  32.45 
 
 		 652 aa  223  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0178105  normal  0.449437 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.95 
 
 		 979 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.41 
 
 		 907 aa  135  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3953  peptidase C1A papain  32.11 
 
 		 381 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000017791 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  28.95 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  27.56 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  27.56 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3826  hypothetical protein  34.48 
 
 		 468 aa  63.5  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2646  peptidase C1A papain  24.14 
 
 		 268 aa  62  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  23.87 
 
 		 255 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  23.42 
 
 		 255 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1330  hypothetical protein  24.53 
 
 		 497 aa  53.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.115696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  25.21 
 
 		 487 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  25.51 
 
 		 535 aa  48.5  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3866  peptidase C1A papain  25.35 
 
 		 284 aa  47.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401195  normal  0.15996 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  22.92 
 
 		 934 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  42.86 
 
 		 814 aa  45.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.590308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>