25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2675 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2675  hypothetical protein  100 
 
 		 688 aa  1417    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1306  peptidase C1A, papain  69.62 
 
 		 688 aa  1008    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0209237  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3580  hypothetical protein  41.02 
 
 		 753 aa  511  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.28463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3867  peptidase C1A papain  36.14 
 
 		 640 aa  360  6e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03990  peptidase C1A, papain  32.99 
 
 		 592 aa  290  7e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3953  peptidase C1A papain  31.64 
 
 		 381 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000017791 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3073  hypothetical protein  28.17 
 
 		 652 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0178105  normal  0.449437 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3428  hypothetical protein  28.17 
 
 		 652 aa  134  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.62 
 
 		 907 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.77 
 
 		 979 aa  98.6  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  28.73 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  27.8 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  27.6 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2646  peptidase C1A papain  27.86 
 
 		 268 aa  63.5  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  23.08 
 
 		 934 aa  61.6  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1330  hypothetical protein  29.67 
 
 		 497 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.115696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1250  peptidase C1A papain  26.94 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0216738  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  26.92 
 
 		 820 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  24.14 
 
 		 255 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  24.88 
 
 		 255 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  23.7 
 
 		 395 aa  52  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3826  hypothetical protein  33.8 
 
 		 468 aa  49.7  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3866  peptidase C1A papain  26.75 
 
 		 284 aa  48.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401195  normal  0.15996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2994  peptidase C1A papain  42.11 
 
 		 405 aa  45.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.766742  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3607  peptidase C1A papain  26.07 
 
 		 270 aa  44.3  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>