23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3580 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3580  hypothetical protein  100 
 
 
753 aa  1547    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.28463  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1306  peptidase C1A, papain  39.45 
 
 
688 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0209237  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2675  hypothetical protein  41.02 
 
 
688 aa  514  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3867  peptidase C1A papain  34.31 
 
 
640 aa  320  7e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03990  peptidase C1A, papain  32.11 
 
 
592 aa  256  8e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3428  hypothetical protein  28.04 
 
 
652 aa  135  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3073  hypothetical protein  28.04 
 
 
652 aa  134  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0178105  normal  0.449437 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3953  peptidase C1A papain  32.14 
 
 
381 aa  125  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000017791 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.52 
 
 
907 aa  101  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.31 
 
 
979 aa  99.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3826  hypothetical protein  29.86 
 
 
468 aa  55.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  24.75 
 
 
271 aa  55.5  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  24.75 
 
 
271 aa  54.7  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  25.34 
 
 
934 aa  52.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  24.92 
 
 
272 aa  52  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1330  hypothetical protein  32.24 
 
 
497 aa  50.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.115696  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  21.71 
 
 
395 aa  50.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04739  cysteine protease  51.43 
 
 
270 aa  48.1  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2994  peptidase C1A papain  41.18 
 
 
405 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.766742  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  24.72 
 
 
820 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04730  cysteine protease  48.57 
 
 
312 aa  46.6  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0404654  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  25.17 
 
 
1242 aa  45.4  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1250  peptidase C1A papain  25.95 
 
 
477 aa  44.7  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0216738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>