26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1306 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1306  peptidase C1A, papain  100 
 
 
688 aa  1425    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0209237  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2675  hypothetical protein  69.62 
 
 
688 aa  1000    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3580  hypothetical protein  39.45 
 
 
753 aa  530  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.28463  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3867  peptidase C1A papain  36.15 
 
 
640 aa  360  4e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03990  peptidase C1A, papain  32.75 
 
 
592 aa  283  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3953  peptidase C1A papain  30.13 
 
 
381 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000017791 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3428  hypothetical protein  26.69 
 
 
652 aa  125  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3073  hypothetical protein  26.53 
 
 
652 aa  124  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0178105  normal  0.449437 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.38 
 
 
907 aa  114  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.61 
 
 
979 aa  92.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  26.96 
 
 
272 aa  65.5  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  26.91 
 
 
271 aa  64.7  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  25.62 
 
 
255 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  26.91 
 
 
271 aa  63.9  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  26.47 
 
 
255 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2646  peptidase C1A papain  25.74 
 
 
268 aa  60.8  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1330  hypothetical protein  26.27 
 
 
497 aa  60.8  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.115696  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  27.31 
 
 
820 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3826  hypothetical protein  35.46 
 
 
468 aa  58.2  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1250  peptidase C1A papain  25.33 
 
 
477 aa  57.8  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0216738  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  25.89 
 
 
395 aa  54.3  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  22.6 
 
 
934 aa  51.6  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3866  peptidase C1A papain  27.39 
 
 
284 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401195  normal  0.15996 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  25.11 
 
 
305 aa  45.8  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3607  peptidase C1A papain  25.82 
 
 
270 aa  46.2  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  24.77 
 
 
535 aa  44.7  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>