12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3953 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3867  peptidase C1A papain  91.3 
 
 		 640 aa  685    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3953  peptidase C1A papain  100 
 
 		 381 aa  788    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000017791 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.46 
 
 		 979 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.16 
 
 		 907 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2675  hypothetical protein  31.64 
 
 		 688 aa  137  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03990  peptidase C1A, papain  32.11 
 
 		 592 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1306  peptidase C1A, papain  30.13 
 
 		 688 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0209237  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3580  hypothetical protein  32.14 
 
 		 753 aa  116  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.28463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1330  hypothetical protein  28.89 
 
 		 497 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.115696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3826  hypothetical protein  33.12 
 
 		 468 aa  55.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3073  hypothetical protein  25.28 
 
 		 652 aa  53.1  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0178105  normal  0.449437 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3428  hypothetical protein  24.24 
 
 		 652 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>