15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3428 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3428  hypothetical protein  100 
 
 		 652 aa  1299    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3073  hypothetical protein  97.85 
 
 		 652 aa  1272    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0178105  normal  0.449437 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03990  peptidase C1A, papain  32.45 
 
 		 592 aa  226  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3867  peptidase C1A papain  28.35 
 
 		 640 aa  151  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3580  hypothetical protein  28.04 
 
 		 753 aa  131  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.28463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2675  hypothetical protein  28.17 
 
 		 688 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1306  peptidase C1A, papain  26.69 
 
 		 688 aa  125  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0209237  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  24.81 
 
 		 271 aa  55.1  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  24.81 
 
 		 271 aa  55.1  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2646  peptidase C1A papain  26.78 
 
 		 268 aa  54.3  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  25.99 
 
 		 272 aa  53.9  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  24.53 
 
 		 255 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3953  peptidase C1A papain  24.24 
 
 		 381 aa  52.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000017791 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  24.65 
 
 		 255 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  25.82 
 
 		 934 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>