27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3867 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3953  peptidase C1A papain  91.3 
 
 		 381 aa  685    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000017791 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3867  peptidase C1A papain  100 
 
 		 640 aa  1326    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1306  peptidase C1A, papain  36.15 
 
 		 688 aa  360  4e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0209237  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2675  hypothetical protein  36.18 
 
 		 688 aa  354  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03990  peptidase C1A, papain  35.66 
 
 		 592 aa  344  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3580  hypothetical protein  34.31 
 
 		 753 aa  311  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.28463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.46 
 
 		 979 aa  159  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3073  hypothetical protein  29 
 
 		 652 aa  154  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0178105  normal  0.449437 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3428  hypothetical protein  28.35 
 
 		 652 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.45 
 
 		 907 aa  148  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  28.52 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2646  peptidase C1A papain  29.41 
 
 		 268 aa  75.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  26.62 
 
 		 271 aa  70.1  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  26.62 
 
 		 271 aa  70.1  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  26.42 
 
 		 255 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3826  hypothetical protein  30.39 
 
 		 468 aa  56.2  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1330  hypothetical protein  29.86 
 
 		 497 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.115696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  25 
 
 		 255 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  27 
 
 		 535 aa  54.3  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  24.4 
 
 		 934 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  23.83 
 
 		 395 aa  51.2  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1250  peptidase C1A papain  23.28 
 
 		 477 aa  50.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0216738  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  28.07 
 
 		 1242 aa  49.3  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  36.47 
 
 		 487 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  36.56 
 
 		 494 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3607  peptidase C1A papain  24.23 
 
 		 270 aa  44.3  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  34.09 
 
 		 619 aa  43.9  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>