40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3866 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3866  peptidase C1A papain  100 
 
 		 284 aa  578  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401195  normal  0.15996 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  29.6 
 
 		 271 aa  89.4  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  29.6 
 
 		 271 aa  89  8e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  29.69 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  29.82 
 
 		 255 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  28.9 
 
 		 255 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0734  cysteine protease  27.07 
 
 		 323 aa  79  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2646  peptidase C1A papain  28.38 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  29.03 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  26.13 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  29.41 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  29.51 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0109  peptidase C1A papain  27.73 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0130  peptidase C1A papain  28.03 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4065  peptidase C1A, papain  31.07 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.561338 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  25 
 
 		 820 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  27.71 
 
 		 934 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  26.98 
 
 		 535 aa  54.3  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  26.58 
 
 		 789 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4188  peptidase C1A papain  23.75 
 
 		 599 aa  52.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1673  peptidase C1A, papain  27.14 
 
 		 368 aa  52.4  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00360531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  25.84 
 
 		 1628 aa  52  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  26.96 
 
 		 1202 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45795  predicted protein  40.24 
 
 		 666 aa  50.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189195  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2994  peptidase C1A papain  27.4 
 
 		 405 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.766742  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  26.81 
 
 		 812 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1250  peptidase C1A papain  25.55 
 
 		 477 aa  49.7  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0216738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1306  peptidase C1A, papain  27.39 
 
 		 688 aa  49.3  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0209237  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2675  hypothetical protein  26.75 
 
 		 688 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03990  peptidase C1A, papain  25.35 
 
 		 592 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  26.29 
 
 		 1096 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1038  hypothetical protein  25.36 
 
 		 475 aa  45.8  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  24.07 
 
 		 494 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  45.24 
 
 		 814 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  27.05 
 
 		 1066 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  33.77 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  22.9 
 
 		 1242 aa  44.3  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3607  peptidase C1A papain  26.11 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  24.14 
 
 		 619 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  26.17 
 
 		 487 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>