43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3000 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  100 
 
 		 255 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  95.69 
 
 		 255 aa  498  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  49.62 
 
 		 272 aa  259  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  50.58 
 
 		 271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  50.58 
 
 		 271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2646  peptidase C1A papain  48.85 
 
 		 268 aa  244  8e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  32.99 
 
 		 305 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  33.33 
 
 		 303 aa  135  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  35 
 
 		 307 aa  132  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0130  peptidase C1A papain  31.07 
 
 		 307 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0734  cysteine protease  31.96 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0109  peptidase C1A papain  30.25 
 
 		 308 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  29.66 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  28.35 
 
 		 934 aa  95.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1250  peptidase C1A papain  28.63 
 
 		 477 aa  91.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0216738  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3866  peptidase C1A papain  29.82 
 
 		 284 aa  86.3  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401195  normal  0.15996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  24.65 
 
 		 789 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1306  peptidase C1A, papain  26.32 
 
 		 688 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0209237  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  25 
 
 		 820 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3867  peptidase C1A papain  26.42 
 
 		 640 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3515  peptidase C1A papain  23.26 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.071303  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  25.22 
 
 		 535 aa  64.3  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1673  peptidase C1A, papain  26.07 
 
 		 368 aa  62  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00360531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04739  cysteine protease  25.66 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03990  peptidase C1A, papain  24.32 
 
 		 592 aa  59.3  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04730  cysteine protease  24.12 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0404654  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3607  peptidase C1A papain  28.22 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3428  hypothetical protein  25.2 
 
 		 652 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3073  hypothetical protein  24.8 
 
 		 652 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0178105  normal  0.449437 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  29.2 
 
 		 619 aa  55.8  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4065  peptidase C1A, papain  25.66 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.561338 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2675  hypothetical protein  24.88 
 
 		 688 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2994  peptidase C1A papain  23.36 
 
 		 405 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.766742  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  29.66 
 
 		 814 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4188  peptidase C1A papain  25.57 
 
 		 599 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  24.36 
 
 		 1242 aa  52  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  26.16 
 
 		 487 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  38.3 
 
 		 354 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  21.89 
 
 		 494 aa  46.6  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  25.11 
 
 		 1628 aa  46.6  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  23.5 
 
 		 1066 aa  45.4  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25433  predicted protein  24.26 
 
 		 360 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3580  hypothetical protein  24.54 
 
 		 753 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.28463  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>