24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3515 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3515  peptidase C1A papain  100 
 
 
307 aa  621  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.071303  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04730  cysteine protease  33.64 
 
 
312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0404654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04739  cysteine protease  33.48 
 
 
270 aa  132  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  28.77 
 
 
535 aa  92.4  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  28 
 
 
487 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  25.89 
 
 
820 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  26.67 
 
 
789 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  24.24 
 
 
255 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  23.74 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  26.09 
 
 
934 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  25 
 
 
494 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  25.63 
 
 
1242 aa  52.8  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  24.19 
 
 
305 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  24.72 
 
 
303 aa  48.9  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0145  hypothetical protein  25.76 
 
 
712 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  22.14 
 
 
307 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0109  peptidase C1A papain  20.53 
 
 
308 aa  46.2  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2646  peptidase C1A papain  26.27 
 
 
268 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  23.13 
 
 
271 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  23.13 
 
 
271 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  23.28 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  24.47 
 
 
1628 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  28.24 
 
 
272 aa  43.1  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3867  peptidase C1A papain  39.47 
 
 
640 aa  42.7  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>