46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2670 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  100 
 
 
307 aa  638    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0109  peptidase C1A papain  63.19 
 
 
308 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0130  peptidase C1A papain  62.87 
 
 
307 aa  424  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  57.84 
 
 
303 aa  393  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0734  cysteine protease  64.55 
 
 
323 aa  394  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  51.44 
 
 
305 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  39.93 
 
 
395 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  34.29 
 
 
255 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  33.93 
 
 
255 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  32.53 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  32.53 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  33.68 
 
 
272 aa  119  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2646  peptidase C1A papain  30.24 
 
 
268 aa  99.8  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3866  peptidase C1A papain  26.13 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401195  normal  0.15996 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  26.85 
 
 
814 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  28.33 
 
 
934 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04739  cysteine protease  25.53 
 
 
270 aa  63.2  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04730  cysteine protease  25.11 
 
 
312 aa  62.8  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0404654  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1250  peptidase C1A papain  26.32 
 
 
477 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0216738  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  27.16 
 
 
820 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  28.68 
 
 
812 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4065  peptidase C1A, papain  27.87 
 
 
224 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.561338 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  24.82 
 
 
789 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  28.14 
 
 
1066 aa  56.2  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  26.36 
 
 
1236 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  24.63 
 
 
1202 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  30.39 
 
 
494 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3607  peptidase C1A papain  25.1 
 
 
270 aa  49.3  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  39.13 
 
 
1332 aa  48.5  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3515  peptidase C1A papain  22.51 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.071303  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  42.86 
 
 
1628 aa  47.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  25.96 
 
 
725 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1038  hypothetical protein  24.9 
 
 
475 aa  47.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  37.93 
 
 
354 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  41.67 
 
 
1242 aa  46.2  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  26.72 
 
 
487 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0559  peptidase C1A papain  42.31 
 
 
2353 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.735343  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2547  hypothetical protein  22.3 
 
 
353 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  43.75 
 
 
535 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0222  peptidase C1A, papain  40.38 
 
 
497 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107237  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2509  hypothetical protein  36 
 
 
364 aa  43.5  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2675  hypothetical protein  21.53 
 
 
353 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0903  peptidase C1A, papain  41.51 
 
 
496 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2639  hypothetical protein  36 
 
 
364 aa  43.5  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  36.76 
 
 
1092 aa  43.5  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45795  predicted protein  41.38 
 
 
666 aa  42.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>